En 2007, el técnico informático y músico Giovanni Maria Pala propuso la idea de que existe una **melodía oculta en el cuadro. Sugirió que las líneas horizontales del mantel que se cruzan con el pan y las manos de los discípulos **corresponden a notas musicales. Tocado al revés, se obtiene un réquiem melancólico, pensado para ser tocado en un órgano de tubos, que refleja el momento sombrío. Aunque la teoría pone de relieve el potencial del artista para el simbolismo complejo y los mensajes ocultos en su obra, sigue siendo objeto de debate si da Vinci colocó deliberadamente estos elementos como notas musicales o se trata simplemente de interpretaciones casuales.